真菌瘿蚊的为害特点是在秋冬春季为危害期，幼虫咬食菌丝和菇体。在丰富的食源中，幼虫以幼体繁殖，很快就在培养料和菇体的菌褶内爬满了幼虫，使带虫的菇体降低了商品性。瘿蚊幼虫也能携带杂菌，致使病菌在伤口上侵入而引发病害。所以,病害和虫害是会交叉感染的，有了虫害会产生病害,发生病害会引来害虫危害。
    真菌瘿蚊的综合防控要做到：一是栽培场地远离污染源,搞好环境卫生。
    二是菇棚用70目的防虫网围罩，防止成虫、蚤蝇和微小的害虫飞入产卵为害。
    三是在无电源的菇棚可用黄板诱杀。用黄色的粘虫板悬挂于菇袋上方，待黄板上粘满成虫后再换上新虫板。
    四是用频振式诱虫灯。选用频振式诱虫灯诱杀菇蚊成虫，将诱杀灯悬挂于菇棚离地1.8米高处，每隔10—15米安装一台，在晚上6时至早上7时开灯，在菇蚊成虫羽化期使用，可诱杀大量的成虫。