1、温度不适。菌丝在培养料内长透之后，如室温是在平菇品种适宜的温度范围之内，便很快出现菇蕾。如温度过高、过低都会抑制原基形成。处理方法：（1）、针对各品种对温度的要求，适时播种；（2）、破块灌水，即菌丝长满料后，破块灌水3~5天后，在缝隙处有大量原基形成。（3）、加压。当菌丝生长到一定程度，在菌床表面放若干小鹅卵石，平菇很快从石头缝隙处长出。（4）、曝光。利用平菇的光效应，适时进行光照，可促进子实体形成。
2、菌床湿度大，通风不良，或不适当施用氮素营养，都会造成菌丝徒长，料面出现大量气生菌丝，倒伏后形成厚菌被—菌膜，会影响到原基的分化。处理方法是搔菌，即在菌膜出现后，应用铁器在培养料表面全面或打方格进行耙动，除去老菌丝（膜），在压实，同时注意保温保湿，刺激子实体形成。