食用菌营养丰富，风味独特，富含蛋白质、维生素、矿物质等多种营养成分。食用菌生产投资少、见效快、收益好，是广大农村脱贫致富的重要门路。但近年来代料栽培食用菌发展尤为迅速，但在栽培过程中病害的严重日益严重，让菇农束手无策，用药不当造成损失的事件屡屡发生。
    主要虫害是：（一）食用菌害螨： 螨类是食用菌害虫的主要类群，俗称菌虱，它们以若螨，成螨直接取食食用菌丝和子实体，造成播种后不发劳，或发菌后出现 "退菌"现象，并使培养料变黑腐烂、菌丝萎缩，子实体出现凹状的斑眼、枯萎。若为害菇（耳）根，可影响出菇（耳），造成子实体腐烂和畸形，有的还可传播杂菌和病原菌。食用菌中螨的种类很多，危害较大的主要有蒲螨和粉螨两种。蒲螨体形小、瓜籽形，淡黄色或深褐色，肉眼不易看见，多在料面或土粒上或子实体上集中成团，类似"土粉"散落状，粉螨体形较大，白色发亮，不成团，数量多时成粉状。（二）菌蛆 菌蛆是危害食用菌的双翅目昆虫幼虫的总称，它的成虫人们通常又分别称为菇蝇、菇蚊和菇蛆（瘿蚊）等之类，而每一类又各包括许多种类，它们以蛆形幼虫取食各种食用菌的菌丝和子实体，并传播病原菌，危害严重时直接影响食用菌的生产。真菌性病害常见的、危害较大真菌病害有：疣孢霉湿泡病、轮枝霉褐斑病、指孢霉软腐病、蛛网丝枝霉病、镰孢霉萎缩病、蘑菇黄霉菌病、金针菇基腐病、金针菇黑斑病、银耳僵缩病、银耳红粉病等。大部分病原为：木霉 Trichoderma、曲霉 Aspergillus、链孢霉Neurospora、根霉 Rhizopus、毛霉 Mucor、青霉 Penicillium、白色石膏霉 Scpuulariopus等。
    食用菌虫害还是以预防为主，治疗为辅较为妥当。在生产中采取预防的措施有：
    1、农业防治：培养料高温堆制，进行二次发酵处理；覆土选用无病害污染的地段取土，可用下层底土、泥炭土、塘泥、河泥；菇房内外彻底清洗、消毒，废料、病菇及时集中处理，增加通风和降低菇房温湿度。
    2、引种时避免菌种带虫尤其是螨。                                             
    3 、搞好环境卫生，消除菇房周围垃圾，减少杂菌污染。
    4、菇房门窗最好装纱门，以防成虫飞入产卵。
    5、用氯氰菊脂喷洒菇房四壁、地面和床架。
    6、施药要"对号入座"，任何一种病虫都有其共生规律，应选对口农药和最佳防治时期，才能达到杀毒和防治效果。菌袋培养期出现螨害时，可选用克螨特73%乳油，按2000～3000倍稀释喷雾。长菇期禁止使用任何化学农药。当受害菇体及其料层清理后，为防治虫害复发，可采用生物农药和环保型农药。如阿维菌索（100mL/瓶）＋啶虫脒（275mL/瓶）＋灭幼脲（350mL/瓶）这3种农药混后兑水250kg喷雾，对灭虫杀害效果很好，且又符合无公害栽培用药要求。