食用菌萎蔫病是在栽培过程中常见的现象之一。症状表现萎蔫病菌主要浸染菇柄，菇柄感病后萎缩变为褐色，使菇体不再长大，最后变成僵菇。病菌还可分泌一种毒素，毒死蘑菇菌丝和菇蕾。
    发生食用菌萎蔫病主要是由覆土带菌引起的。专家建议覆土要进行消毒。用70℃的蒸汽对覆上进行消毒。覆土层不宜过厚，加强菇房通风。当然也可在患病部位喷托布津或多菌灵500倍液进行防治。总体上需要通过以下六个方面进行防治。
1.通风透气。在播种后的4天内，每天上午10点左右通风半小时，随着菌丝量的增多通风要延长每天2小时。
2.及时施药。当料面上出现霉菌时，在污染区撒一层生石灰粉，同时加强通风降温，抑制杂菌蔓延。
3.拌料早防。用玉米芯、麦秸、稻草做主料时，底添加5％麸皮或4％发酵腐熟的畜禽粪。
4.酸碱适中。配料时加入的石灰量要达到5％，每采完一茬菇后要喷1％的石灰水或4％的草木灰水，提高pH值。
5.降温保温。盛夏要喷水并搭棚遮阳降温，减少菇房温差。喷水要在早晚进行，水温以30℃左右为好。
6.湿度适宜。一般培养料的最适合水量为70％，菌丝体生长期空气相对湿度为80％为宜，子实体生长阶段空气相对湿度保持在90％为宜。