香菇栽培过程中从菌丝培养到出菇期间发生的一种腐烂病称之为菌棒“烂棒”。症状通常为自表层以斑块大小局部出现，然后逐渐蔓延并深入整条菌棒，受害部位初期表现为菌丝逐渐消失，并附有粘液状黑色分泌物或其它霉层，随着受害程度的加剧，培养料发黑变软腐烂，受害后期菇木因腐烂和水溶物增多而松瘫、解体，培养料呈黑色烂泥状，并伴有特殊臭味。严重时菇棒腐烂殆尽，香菇绝收。
    烂棒的发生原因：
    ①培养料配比不合理，拌料不均匀，尤其是尿素、过磷酸钙、石灰石粉、硫酸镁等添加物超浓度使用。一旦遇高温气候和刺孔通气后料温过高，便会影响菌丝正常生长，最终导致菌丝死亡而烂棒。
    ②培养室长时间通气不良、二氧化碳浓度过高、氧气含量不足常致使菌丝以酵解方式分解养分以维持生命活动。既消耗掉过多养分，又产生大量有害物质影响菌丝生长发育。
    ③培养室温度长期过高，超出香菇适宜生长温度范围，刺孔通气后又没有及时疏散菌棒，使堆温大幅度升高，致使菌丝生长脆弱甚至死亡，引起所谓“烧菌”现象。菌棒上淤积黄水过多，一方面影响通气，另一方面极易造成杂菌感染，尤其是青霉感染。
    ④菌棒受阳光直射，强烈阳光所内含的紫外线会把菌棒内菌丝灼伤，到一定程度菌丝会被杀死，菌棒局部出现黄水，随后滋生霉菌。
    ⑤生长环境阴湿，空气相对湿度过高也会导致烂棒的发生。另外，在给菌棒补水时，水温过高、补水过量同样会导致菌棒烂筒。补水后菌棒表层水分尚未沥去就急于覆盖薄膜也易导致菇木烂筒。
    ⑥大量的“假菇”发生后不久萎缩腐烂，会滋生绿霉。若再遇高温闷热天气，通风不及时常会导致菌棒烂棒。
    ⑦采菇时菌棒上留有残根或割袋出菇时没及时剔除死菇蕾而发生霉烂。采菇粗放、对于没完全转色的菌棒随菇脚采下大块培养料，菌丝受损伤后再遇有水珠残留，极易滋生霉菌导致烂棒。