木腐型食用菌是指生活在枯枝朽木上的一类大型真菌，我们常见的有平菇、金针菇、香菇、白灵菇、木耳等，以下是在生产中经常遇到的几个问题及其解决办法。
     菌丝满袋后迟迟不出菇
     菌袋菌丝生长旺盛，满袋后迟迟不出菇，经2-3个月仍不现蕾。主要原因及解决方法：1、料的碳氮比不适宜，氮素过多，碳素不足，导致营养过旺，菌丝徒长，甚至浓密成一团，结成菌皮，而使生殖生长受到抑制，推迟出菇。对于麸皮、豆饼、玉米粉等含有丰富的氮素，添加时应掌握适量，严格按栽配料配方进行配制；2、菌丝长满后，在温度较高、空气湿度较低的情况下，过早地打开袋口，表面形成一层干燥的厚菌膜，使菌蕾不能分化。遇此情况，可用铁丝在菌袋两端戳一个洞，再用小钉耙扒去表面干菌膜，将菌袋浸入25℃以下水中8-12小时，待吸足水分后重新排放架上，给与通风、光照和温差刺激，增加空气湿度，就会很快出菇。
     菌丝未长满袋就出菇
     栽培过程中经常遇到菌丝只生长了1／3或2／3时，就出现菌蕾的现象。
     主要原因：菌丝培养阶段环境条件不适应，如培养料过干过湿，装袋时压得太紧，培养基内营养成分差，光线过强，温差较大，酸碱度不适宜;或因菌龄太老，菌丝生活力减退等。
     解决方法：创造适宜菌丝生长发育的最佳条件，包括配料、含水量、酸碱度、温度、光照等，都要适合食用菌营养生长的需要；选择优质、生活力强的菌种。
    部分料袋只在一端生长菌丝
    在一个料袋的两端接入同一菌种，往往只有一端菌丝生长良好，另一端则菌丝萎缩死亡。主要原因：1、灭菌灶建造不合理，冷凝水不能沿灶壁回流入锅，而有一部分不规则地流入袋口内，使此端培养料吸水太多，抑制了菌丝的生长；或料袋紧靠锅壁排放，锅装水太多，互相间空隙太少，使蒸汽循环受阻，冷凝水从灶壁流入袋口，造成此端培养料过湿，影响菌丝生长；2、此段袋口扎得过紧，氧气不足，也会使菌丝生长受阻。
    解决方法：灶顶建成圆拱形，使冷凝水能从灶壁回流锅内，料袋排放应与灶壁间有一定距离，以免进水。另外，料袋不要排得过挤，以加速水蒸气循环，提高灭菌效果。用橡皮筋或绳扎口的料袋，菌丝定植后要把口松开一些，以增加通气量，避免缺氧而造成菌丝死亡。
    菌袋中间出现大量菇蕾
    有的菌袋在菇蕾分化期，料袋周围壁内出现大量菇蕾，由于菌蕾受到薄膜袋的挤压不可能长成菌菇，造成营养流失而影响产量。
    主要原因：装料不紧实，料与袋之间有空隙，灭菌时压力过大，涨破料袋或使料袋鼓起；装料或搬运中料袋刺破；菌丝生长阶段培养环境不适，如温差过大、光照过强、空气湿度较高等，均会促使料袋中部产生子实体原基。
    解决方法：装料要边装边压实，外紧内松，料与袋壁紧密接触、不留空隙；装料搬料要小心，避免料袋破损，蒸料后要缓缓放气；培养室应进行避光，保持温度恒定，相对湿度维持在70%左右；菌种培养室和出菇场地要分开。
    袋栽出现烧菌现象
    烧菌是菌袋内菌丝生长环境的温度过高，超过了菌丝生活力范围而造成菌丝死亡现象。大部分的食用菌菌丝生长阶段，当培养料内温度超过35℃时，菌丝生命力将出现减退，超过40℃时就会烧菌。为避免发生烧菌现象，栽培中一定要控制料温不超过35℃。若温度较高，应采取降温措施：打开门窗进行通风、减少袋堆层数并加大袋子之间的空隙等。