预防曲霉菌危害食用菌应采取综合措施。注意搞好环境卫生，保持培养室周围及栽培地清洁，及时处理废料；接种室、菇房要按规定清洁消毒；接种时操作人员必须保证灭菌彻底，袋装菌种在搬运等过程中要轻拿轻放，严防塑料袋破裂；经常检查，发现菌种受污染及时剔除，不播种带病菌种；适当提高培养料的pH值，在拌料时加1%~3%的生石灰或喷2%石灰水，可抑制杂菌生长；采用干料重量0.1%的甲基硫菌灵拌料，效果更好。在菇床培养料上发生曲霉危害，可及时通风干燥，控制室温在20~22℃，杂菌受抑制后再恢复常规管理。