堆制发酵料包括建堆、翻堆与质量鉴定等项技术。
    （1）拌料建堆 用于平菇、草菇栽培的发酵料多以棉籽壳为主要原料，添加2 %的石灰，加水拌料，堆制而成。若在干料中添加豆饼3～5％，或麦麸5～10％，或尿素0.5～1％，或适量干牛粪粉，然后加水堆制，则可获得更好的栽培效果。建堆场所，最好是紧靠菇房的水泥地面，排水良好，避风向阳，且水源干净、便利。建堆时，将干料混匀后，加足水分至培养料含水65～70％（将堆料发酵过程中的水分损失计人其中）。混拌均匀后将料堆成宽1.0～1.3米，高1.0～1.5米．长度不限的料堆。料堆四周尽可能堆陡一些。建堆时，将料抖松抛落。堆成之后，用木棒（直径5厘米左右）在料上插通气孔，每隔0.2来插一孔，以利于通气发酵。建堆后用塑料薄膜覆盖，或用草帘、稻草覆盖。
    （2）适时翻堆 平菇发酵料多在春、秋堆制，建堆后48～72小时应进行第1次翻堆。翻堆时仍须将料抖松，以增加料中含氧量。同时，将上下、里外的培养料互换位置，以便培养料均匀发酵。全部发酵过程历时6～8天，翻堆3～4次即可。时间过长，会大量消耗养分；时间太短，可能发酵不充分，达不到堆料发酵杀灭害虫、害菌的目的。
    草菇发酵料的堆制方法与此基本相同，只是因其堆制时气温较高，不宜覆盖塑料薄膜，翻堆间隔时间缩短为24小时，堆制5天即可。
    （3）发酵料质量检查 在预定时间内（建堆48小时左右）若能正常升温至60℃以上，开堆时可见适量白色菌丝（嗜热放线菌），表示堆料含水适中，发酵正常。如果建堆后迟迟达不到60℃，说明不好。可能培养料加水过多，或堆料过紧、过实，或因未插孔通气等原因造成堆料通气不良，不利于放线菌生长繁殖，堆料不能发酵升温。遇此情况应及时翻堆，将料摊开晾晒，或添加干料至含水量适量，再将料抖松重新建堆发酵。如果堆料升温正常，但开堆时培养料呈白化现象，表示培养料含水太少。可在第1次翻堆时适当添加水分。必须强调一点，应在开始1次加足水分，中途加水是下策。万一中途补水，最好加80℃以上热水。加水拌匀后，重新建堆发醉。
    发酵料进菇房时，添加棉籽壳干重0.1％的敌敌畏，将药料混拌均匀后，即可装袋或铺料播种。