目前，双孢蘑菇正处于出菇阶段，此阶段的管理对于整个双孢菇产量起到很关键的作用，管理也尤为重要。
    1.及时采收，防开伞。一般在现蕾后5-7天，菇盖大小3-4厘米左右，菌膜未破时采收，此时产量最高。出菇阶段要早晚两次采收，采收过程中要注意人工、器械等的消毒工作，采收时要用高锰酸钾溶液将手套、小刀等浸泡消毒处理。
    2.及时喷水。在双孢菇出菇阶段，水分管理是重中之重，出菇后土层喷水的原则，应掌握菇多时多喷，菇少时少喷，无菇时不喷，前期多喷，后期少喷。此外还要根据气候条件，菇房保湿性能，覆土土质及厚度等具体情况而定。一般情况下要早晚两次喷水，喷水时要将喷头朝上，喷水不宜重，以免将水滴直接碰到蘑菇上，致使蘑菇上长黑斑，影响商品率。
    3.及时清理死蘑菇、菇根。每次采菇结束后，应及时整理垄面。剔除垄面上的老根死菇，并及时处理掉，以免污染菌棚，引起病害。
    4.及时补土。每次采菇结束后，及时补覆湿润的细土。细土需是早期喷药处理过的无污染土。
    5.及时注射营养液。当头茬蘑菇采收后，原则上要给料注营养液，每6-8垄注营养液1喷雾器，每喷雾器营养液的配比为三分之一两的尿素、四分之一两的磷酸二氢钾、一汤匙葡萄糖(白糖)。
    6.病害防治。搞好菇棚清洁卫生，菇房管理使用的水，最好经过漂白粉处理、严格控制菇棚温度与湿度，菇棚温度应控制在20℃，相对湿度保持在85-95%，每次喷水后都要通风换气至菇体表面没有水渍，菇床一旦发病后及时清除感病子实体，然后喷农用链霉素或含氯的漂白粉、万消灵水溶液等。