近几年来，各地利用棉籽壳、玉米芯、豆秸、稻草、玉米秸等农作物下脚料栽培食用菌，发展迅速，经济效益显著，但栽培食用菌后的菌糠却大量废弃。能否将这些菌糠作为饲料利用起来，是一个值得研究和探讨的问题。
　　据有关分析报道证明，菌糠与培养料相比，维生素和木质素明显降低，蛋白质和无氮浸出物均有增加，并含有家畜、家禽需要的钙、钠、镁、铁、钴、锰等矿物元素。例如，棉籽壳菌糠中的粗蛋白含量可比棉籽壳提高一倍多，与玉米、小麦麸皮中的粗蛋白含量相近。更重要的是它含有多种氨基酸，其中有几种是畜禽体内不能合成的，而一般饲料中又比较缺乏。不仅如此，栽培食用菌后的菌糠，大大降低了棉酚和和霉菌毒素的含量，改变了角质层及纤维素整体结构的的致密性，机械强度减弱，气味芳香，适适口性明显提高。
　　菌糠作为饲料应用完全可行，但菌糠品质的好坏直接影响到利用价值的高低。凡是菌丝生长旺盛，表面被除数覆一层白色菌丝体膜，无杂菌污染，子实体分化良好的为上品；菌丝体生长较差，尚有少部分培养料未生菌丝，串结不良，无杂菌污染的为中品；菌丝稀少，生长不良，杂菌污染严重，出现酸、臭等异味，子实体难以分化的为劣品。上中品可用作畜禽饲料，下品就不要喂畜禽了。对栽培食用菌后的菌糠，要及时收集起来，防止混入土和其它杂质，晾干粉碎后，按一定比例混频器入配合饲料中即可应用。经验证明，以加少水少许拌湿饲喂较好，加水呈以手握成团逐步共聚合不滴水为宜。菌糠占饲料总量的比例是：25公斤左右的仔猪15-20%，35公斤以上的育肥猪20—30%，成年母猪20—40%，牛30—50%，鸡最多不超10%，按以上的饲料配比添加菌糠，可代替同等数量的精料。