在食用菌的制种和生产中，灭菌和消毒是必须把好的一个重要环节，而利用化学药剂来灭菌和消毒又是一个重要手段。化学消毒灭菌药剂的使用，可根据灭菌对象、药品性能、设备机械和环境条件等，采用浸泡、冲洗、擦拭、喷洒、熏蒸和撒粉等方法来达到灭菌消毒的目的。常用消毒药剂的配制和使用技术介绍如下：
　　1、福尔马林：福尔马林是含36-38%的甲醛溶液。由于它能使蛋白质凝固而具有杀菌作用，是重要的消毒剂。5%福尔马林可杀死细菌芽孢和真菌孢子。常用于消毒接种箱（室）、培养室。一般每立方米空间用5-10毫升。在蒸发或低温下贮放较久时，常聚合成白色絮状沉淀，将其加热沉淀即可消失。
　　2、酒精：酒精的杀灭能力主要是脱水作用，可使细菌蛋白质脱水变性导致死亡，能溶解酯类分泌物，也有机械除菌作用。常用70-75%酒精进行皮肤和各种器皿消毒。浓度过低和过高都不理想，过低时脱水能力差，过高时由于过快地使菌体表层蛋白质脱水而凝固，妨碍酒精向深层渗透，内部结构未遭破坏，杀菌作用反而降低。酒精易燃、易挥发，应密封保存，远离火源。用95%酒精75毫升，加水20毫升妤中配制成75%的酒精。
　　3、苯酚：苯酚又叫石炭酸，可使疑团莫释蛋白质变性沉淀，可使细胞膜破坏而杀死多数细菌。但对真菌孢子作用不大。纯净的苯酚是无色针六晶体，具有特殊的气味。常用3-5%的苯酚溶液喷雾消毒接种室（箱）或对器皿消毒。苯酚有毒，毒物危害程度为Ⅲ级（中度危害），对皮肤有腐蚀性，接触皮肤时可用清水洗涤。配制时，取苯酚50克加入到1000毫升蒸馏水中即可配成5%的苯酚水溶液，是一种常用的消毒剂。
　　4、来苏儿：来苏儿是甲苯酚三种异构体的混合物，又名煤酚皂溶液。是含有50%的煤酚有肥皂溶液，属良好的消毒剂，杀菌能力比苯酚强四倍。常用1-3%的来苏儿水溶液对皮肤及各种器械消毒。用3-5%的水溶液于器皿、污物浸泡（约1小时）消毒。也可喷雾对接种箱（室）消毒。配制时，取50%来苏儿30毫升加水470毫升即可得到3%的来苏儿溶液。
　　5、高锰酸钾。高锰酸钾是一种强氯化剂。0.1%的浓度有消毒作用，2-5%的溶液对芽孢有效，也能杀死厌氧菌。常用0.1%高锰酸钾对器皿表面消毒，也可用1份结晶的高锰酸钾倒在二份甲醛溶液中对接种室（箱）熏蒸消毒。每立方米用高锰酸钾5克。
　　6、漂白粉。漂白粉是一种有刺激性气味的白色粉末，其有效成分是次氯酸钙。它溶于水分解成次氯酸，当渗入细菌体内，可使蛋白质变性，从而起到杀菌作用。常用2-5%漂白粉溶液洗刷接种室、培养室墙壁、床壁等。由于其易吸收空气中的水分和二氧化碳生成次氯酸而失效，所以应保持在密闭的容器里，存放于干冷处。
　　7、新洁尔灭。新洁尔灭又叫（十二烷基二甲基苯甲基溴化铵），为淡黄色胶体状，具有芳香味。原液浓度为5%，用时稀释成0.25%即可。常用于接种箱、玻璃器皿表面消毒，对细菌和病毒有较好的杀灭能力。对皮肤及粘膜有轻度刺激，严重者可产生皮疹。
　　8、石灰。是碱性物质，可提高培养料或环境的pH值，从而掏大多数酵母菌及霉菌的生长繁殖而达到消毒的目的。使用时可用生石灰盖在霉菌污染处。也可配制成5-10%的水溶液喷洒，或用0.5-2%的水溶液浸泡稻草和麦秸等培养料。
　　9、升汞。升汞又名氯化汞，有剧毒，毒物危害程度为Ⅰ级（极度危害）。杀菌作用较强。0.1%的升汞液几分钟内就可杀死细菌的营养细胞，常用0.1-0.2%溶液对种菇、种水、玻璃器皿及非金属器械表面消毒。配制时取升汞1克加1000毫升蒸馏水即可得到0.1%的升汞溶液。如升汞与皮肤接触，可用大量水冲洗后，湿敷3-5%硫代硫酸钠溶液。升汞液应装在棕色玻璃瓶中贮存。