双孢蘑菇冬季管理的主要工作是棚外防火、防大风、防雪压；棚内让培养料中菌丝能呼吸到新鲜空气，让覆土层水分含量逐渐下降，以后保持湿润，菌丝不干瘪，床面尽量不受冻。
　　控制水分天冷后菇棚内喷水量应逐渐减少，让土层湿度降至不出菇为宜。
　　清理菇床出过菇的菇床将残菇、老根、死菇等挑出运走，补上新土。土面较硬、通气性差的，应破除板结，增加通气透水性。
　　菇棚保温用秸秆或草帘围盖大棚，并用铁丝或绳索揽紧，防止大风危害，保温防冻。
　　通风换气菇床温度在10℃以上时每天对流通风，天暖时通风3～4小时，天冷时打开棚的一头通风，轮流揭盖通风，保持空气清新。长期低温情况下（菇床温度低于8℃），可以减少通风时间和次数，或结合喷水通风。
　　喷水保湿土壤水分过干菌丝易干瘪，不利于春季出菇，应注意喷水保湿。每周结合通风喷两次水，每次每平方米喷水0.4公斤，保持土壤表面不发白、湿润即可，不能过湿。
　　出菇管理菇床温度稳定通过10℃时（3月下旬后），先大通风几天，再按出菇管理要求正常通风、喷水。