一、发菌管理
　　1．控温发菌：库顶最高处温度低于22℃，让菌丝在适温环境下生长。
　　2．定时通风：每天早晚各1次，每次30分钟。
　　3．及时消杀：要定期检查，及时处理污染和被害菌袋。库内每周用敌敌畏、多菌灵喷雾消毒杀虫1次。
　　4．控湿避光：湿度控制在60％～65％，非操作管理时关闭光源。
二、出菇管理
　　1．降温：将库内温度由菌丝生长期的20℃～22℃降到13℃～16℃，2～3天后菌袋冷透后转入下步管理。
　　2．杀虫：用80％敌敌畏乳油500～1000倍液自上而下空间喷雾，药量2～4毫升/立方米，再用浸透药液的布条悬挂在通风口、门口处，借以杀灭库内菇蝇、菇蚊、跳虫和螨类。闷10小时后转入下步管理。
　　3．杀菌加湿：用克霉灵2000倍液自上而下喷雾，药量1次3～5小袋／100立方米，药液要打湿菌袋、架板，如发菌期间杂菌较多，初始的2～3天内，均用2000倍液克霉灵进行加湿，若湿度还不够，再用井水补喷，2～3天内使库内湿度稳定在85％即可开袋。此阶段1天通风3～4次，使空气新鲜。
　　4．解绳撑袋：如库内湿度不够或近风口的地方，袋口可撑起一半，待湿度稳定后再全撑开。解口后，若端面为绿霉污染须再绑住，让未污染的端面出菇。若端面为粉红色面包霉污染，须扎紧两端袋口远弃，用克霉灵500倍液自上而下喷淋周围菌袋。库温随即降至12℃～15℃，进入催蕾期。
　　5．催蕾期：恒湿（85％）和空气清新是诱导菇蕾形成的环境条件。由于库结构和通风能力不同，短的1次通15分钟，长的须通30分钟，长时间的通风对湿度影响很大，在进风管道加雾化效果很好的水嘴，微电机带动与通风或制冷同步运行。加湿降到地面的水当中含有大量二氧化碳，最好能导出库。此阶段湿度恒定就会更易形成菇蕾，过高的湿度会使端面菌丝旺长，过低的湿度会使端面板结菌丝结皮不出菇。10～12天，培养料表面就会出现琥珀色的水珠，这是菇蕾出现的前兆，不久，米白色的原基就会整齐地出现在培养料表面。
　　6．抑制期：当库内80％菌袋现蕾，幼菇长至0.8～1.5厘米时，库温降至4℃～6℃，增加库与外界通风和库内循环风量，使子实体生长受到抑制，使幼菇变得粗壮。此时湿度80％～90％，时间5～7天，是增加菇体重量，提高商品性的关键时期。此阶段还可有弱光存在。
　　7．伸长期：减少通风增加二氧化碳浓度，促使菌柄迅速伸长生长。库温10℃～12℃，湿度85％～90％，通风次数要少，时间略长，保持干湿交替，利于菌柄的伸长和防止细菌性斑点病的发生。15天后，菌盖直径0.8～1.3厘米，菌柄长12～15厘米，进入采收期。
三、管理难点分析
　　1．通风：冷库是一个缺氧的环境，半个小时的通风，再经0.5～1小时，二氧化碳浓度又恢复常量，故风量不足是个普遍问题。易形成菇帽尖、柄细长的菇体，就是缺氧的标志。菇体只要处在袋内就不怕通风，库内空气循环对改善菇体状态是必需的。通风与降湿增温的矛盾可通过少通勤通或通风喷雾状水来解决。同时可加喷石灰水来吸收二氧化碳。
　　2．温度：现蕾、抑制、伸长三个阶段所需温度为高、低、中。现蕾前的低温诱导、现蕾期的相对高湿能加速原基发生；抑制期的低温辅以强风，能改善菇体品质，增加产量；伸长期的低温亦有助于增加产量，延长存架期，此阶段亦要改变不敢通风的传统管理办法，因为库内缺氧明显，将严重影响菇柄加粗及其商品性。
　　3．湿度：湿度的大小随温度变化，低温高湿、升温降湿能预防病害发生；高湿利于出菇密，低温高湿利于增加菇重。
　　三者中，温度是发育快慢的关键，对于初次种菇者，在不能很好地预见操作的效果前，最佳的方法是低温求稳，这样可以充分用风来改善菇体商品性。冷库种金针菇高产技术。