双孢菇的个头大小是可以人为控制的，主要措施为：更换菌株 现普遍使用的菌株（品种）为“2796”，是一大粒型杂交种，其主要优势为适应性广、抗逆性强、个头大、产量高，仅符合商家要求规格的相对较少；因此，如有定货合同时，可更换小粒型菌株，尽管产量稍低，但相应符合规格要求的较多。
     改换覆土 覆土层的厚薄，直接影响着子实体个头的大小，其作用机理是，随着覆土的加厚，土层中菌丝密布，但不易扭结，一旦扭结现蕾，周围菌丝便集中营养及水分予以供应，势必长成大个头子实体，因此来不及更换菌株者，可通过调整覆土层厚度加以控制。一般正常覆土要求厚约3厘米——5厘米，可调整为2厘米左右，这样，菌丝易扭结现蕾，现蕾量大时，形成一定的生存竞争，便不易分生“大个菇”。
     适当提温 实践证明，双孢菇生长适温为15℃——20℃，适当提高棚温，可有效增加现蕾数量，使子实体个头大多处于中等偏下水平，其作用机理同上。适时早采 当目测子实体长至符合要求时即予采收，不必非等到七、八分熟不可，早采收看起来好像影响生产效益，其实，由于符合规格要求，提高了商品价值，并且避免了充分长大过多地消耗营养，在以后各潮中会有产量补偿，总体效益会有所提高。