翻垛是菌丝培养期间的一项重要工作，一般每5～7天翻一次（上、下、里外翻均匀），以使菌丝受温一致，发菌整齐。在翻垛时要注意检查有无杂菌污染，有杂菌污染的可单独放置或处理，不可乱扔乱放。若发现菌丝不吃料，应查明原因（是培养料含水量过大，还是原料发霉变质，或是室温太低、菌种老化等），及时采取措施，妥善处理。冬季棚内或室内需生火，要注意通风换气排出废气。