菌糠是指栽培各种菌类以后剩下的废料，实践证明，每100千克培养料收获100千克鲜菇后，还可以得到60千克废料。这些废料均含有大量菌丝体、蛋白质及其他营养物质，被称为“菌糠蛋白”。经适当加工处理，可以作为饲料或添加剂，用于替代一部分饲料用粮及其他营养元素。
    平菇、凤尾菇菌糠饲料
    研究表明，利用棉子壳栽培凤尾菇，菌糠中的粗蛋白从种菇前的5.65％增加到7.9％，粗纤维从种菇前的51.45%减少到9.32%，脂肪略有增加，还原糠从2.1％增加到3.9％，总糠从19.8％增加到25.2％。用棉子壳栽培平菇后，菌糠中粗蛋白比纯棉子壳增加9.30％，无氨浸出物增加9.74％，钙增加59.26％，粗纤维含量则降低17.37％。用稻草栽培凤尾菇，每百千克干物质中17.56％~26％转化为子实体,18.91％~42.27％变为热能消耗，还有40.17％~55.08％留在料中。分析平菇、凤尾菇菌糠中的营养状况，为综合利用这些资源提供了理论依据。
    据有关报道，在每千克含消化能2.762千卡，粗蛋白14.78％，可消化粗蛋白113克的生长肉猪配合饲料中，以45％的平菇菌糠代替等量麸皮，进行比较饲养，菌糠组平均增重60.4克，比麸皮组提高13.96％。
    用菌糠养猪，每增重1千克，养猪成本下降35％。菌糠饲料喂猪，平均每头猪可节约粮食75千克左右，节约成本50元。凡投料2000千克的食用菌专业户，可得菌糠约650千克，可供养3头肥猪，仅此一项可增加产值1200多元。
    金针菇菌糠饲料
    用棉子壳栽培金针菇后，其菌糠能满足生猪生长发育需要，很适合饲养瘦肉型生猪，使生猪增重率达30％～70％，且肉质好。
    香菇菌糠饲料
    香菇菌糠含粗蛋白8．76％、粗脂肪0.62％、粗纤维30．0％、灰分7.93％。每千克菌糠中含钙10.86克、磷3.6克、钾4.04克、钠8.7克、铜0.0049克、镁1.58克、铁0.69克、锌0.06克、锰0.0774克。对菌糠进行科学配方，可喂养猪、鸡、鸭、鹅，使鸡、鸭等家禽产蛋率提高10％~15％。
    香菇菌糠的制作方法：将采收完香菇的菌筒进行认真挑选，除去感染杂菌、黏附污泥；被白蚁侵食及养料严重消耗的菌袋。对转色不好，菌筒上菌皮过厚的应用刀刮去表层再用。对挑选出来的菌筒，用人工或粉碎机进行粉碎，晒干后密封备用。
    利用香菇菌糠喂猪：其喂量要逐步调整，由少到多，使猪有一个适应过程。开始的10天~15天，菌糠的用量在日粮中比例占5%~8％，以后逐渐增加，最高以不超过20％为宜。也可以视饲喂对象不同而添加不同的量：20千克以下的子猪，菌糠用量为8％~12％，30千克以上架子猪，加入量为15％~20％。
    香菇菌糠喂长毛免：以甘蔗渣78％、米糠20%、糠1％和石膏1％为培养料栽培香菇后，把菌糠晒干、打碎，喂养断奶的幼兔，以等量麸皮作对照，喂菌糠饲料组毛长增加，体重增加，可代替部分精料及作添加剂使用。
    香菇菌皮饲料
    香菇菌皮含蛋白质12.62％、粗纤维18.3％、磷0.23％、钨0.57％、总氨基酸9.25％、必需氨基酸4.43％。较一般常规饲料营养丰富。试验表明，用香菇菌皮作饲料添加剂，对提高猪的瘦肉率有很好作用。
    蘑菇菌糠饲料
    经测定，蘑菇菌糠含粗蛋白10.92％、精蛋白9.93％、粗脂肪14％、精纤维3.25％，其余各种营养成分均超过谷物统糠。
    蘑菇菌糠的处理及喂猪方法：除去菌糠中的杂菌和土粒，掺入65％的青饲料、0.5％食盐水，加水拌匀直接喂养生猪。也可以将菌糠及时下床，去掉土层和杂菌，于干燥处放一层菌糠，撒一层0.5％食盐堆积并加盖薄膜，临喂时，取出菌糠与青饲料拌匀即可投入喂养。还可以将菌糠晒干，粉碎加拌青饲料和食盐稀释喂猪。饲喂时，先进行猪的适口性训练，待习惯后，逐渐增加菌糠用量。夏季用菌糠喂猪，能加快育肥，缩短存栏期，提高养猪的经济效益。
    滑菇菌糠
    以木屑和米糠为主料栽种滑菇、金针菇后，所得菌糠量分别是其各自产菇量的6倍和5倍。用菌糠作鸡饲料添加剂时，用于蛋用鸡时的添加量约为新鲜菌糠的2％~3％，饲喂肉用鸡时，约用5％~10％的新鲜菌糠。收集菌糠可以用青贮或风干法储存，现配现饲喂，约在2天~3天将一批料用完。