进入夏季多雨季节，晒干或烘干的干耳、干菇极易吸湿回潮，发霉变质或滋生害虫，影响商品质量。通常的贮藏方法是趁烘烤干燥尚存余热时，迅速分级，装入塑料袋内，扎紧袋口或用烙铁粘合袋口，随即装入衬有防潮纸的木箱、纸板箱或白铁皮箱中密封。为了防止潮气侵入或虫蛀，可在箱内放入石灰包吸潮，同时放一小瓶二硫化碳，然后把箱缝用纸条封严，入库贮藏。另一种方法是密封包装，低温贮藏法。具体做法是：鲜菇干燥后，用纸箱密封包装，纸箱内衬双层防潮纸和一层塑料薄膜，干菇入箱时含水量不得超过13%，在体积为0.2立方米、装菇10千克的纸箱内，可放1个盛5—7克二硫化碳的小瓶（开口），用以避虫；短期（1—6个月）贮存，可置于室温13—17℃的空调室内；长期（半年以上）贮存，置于3—4℃的低温冷库内。空调室和低温室的相对湿度都应在60%以下，并配有抽风机和吸潮机。在4℃干冷条件下，干香菇可以存放2年不变色，不失味，不受虫蛀。