1.成虫虽然寿命短，但产卵数量多。孵化后数量很大的幼虫主要在菌袋内或钻蛀入子产体内危害，所以存在无法直接给幼虫打上药的问题。

    2.会造成药害，很多农药使用不当会造成子实全畸形，如敌敌畏即使不在出菇期使用，也会造成后茬出菇严重扭曲变形，失去商品价值。

     3.安全问题。因为常见的食用菌从出菇到采收根据温度高低短一点的一周，长一点的10来天。具有生长时间较短，同时又具有产品直接为人食用的特点。所以在出菇期用药，稍有不慎会存在农药残留超标的问题。

    所以食用菌双翅目害虫的防治原则要以防为主，防重于治。治虫要求做到治早、治彻底，采取防治措施时要尽量用物理防治措施，采用化学措施要慎重，考虑药效、药害、药物残留。具体来说，可采取以下几点：
    1.双翅目害虫主要为营腐生生活，所以要及时彻底清除菇房周围的老旧料、残菇、垃圾等，短时间存放时要及时喷洒杀虫剂，这样就可以避免。双翅目害虫的大量滋生。垃圾堆、禽舍、牲畜圈棚、厕所要远离菇房，这样就基本上做到了从源头上杜绝害虫的发生。

    2.菇房菇棚必须要在门窗上安装防虫网、纱窗等，出入时随手关门，可以杜绝或减少蚊、蝇成虫飞入菇棚内产卵。
    3.拌料时为防止成虫在料堆内产卵，可加入规定浓度高效、低毒、低残留的农药品种,如BT、苦参碱、除虫菊素及鱼藤酮等。同时一定要进行熟料栽培。

    4.出菇期最好不要使用农药。在出菇倒茬期，也就是没有出菇时可以使用前面介绍的几种农药等向菌棒、墙壁、地面、空间喷洒。

    5.诱杀成虫。菌棒上方20～30厘米处悬挂黄板，每5～10平方米挂一张。还可安装黑光灯配合粘虫板或直接安装杀虫灯。