一、发生原因
1. 灭菌不彻底
① 常压灭菌时，灭菌锅内菌瓶（袋）排放过密，升温过快，冷空气未排净，造成假压。锅炉供气量和常压灭菌锅、灭菌物容量不匹配；锅炉点火后 4h 内使菌袋内温度未达到 100℃。灭菌过程中，使用锅炉上蒸汽灭菌方式，温度没有连续保持 100°C以上。
② 高压灭菌时，灭菌锅内菌袋（瓶）排放过密，灭菌锅炉管道过长，管道保温不足；没有先排除管道内的冷空气，直接进锅，进入的蒸汽不是饱和蒸汽；冷空气没排除干净。
③ 玉米芯、大颗粒木屑等不容易吃透水分的原材料，未提前进行预湿处理，应延长拌料时间，否则容易出现因大颗粒内部吃不透水分而出现灭菌不彻底的情况。
④ 麦粒浸泡过湿、填料过松都能造成灭菌不彻底而引起内源性污染。
2. 接种污染
在流水线净化间内 FFU 层流罩下接种，没有经常检测净化间的沉降菌菌落数，区域没有达到千级标准，无菌操作不严格，接种环境不清洁。
3. 接种量不足
有的菌类菌丝生长速度比较慢，接种量不足，菌丝没能尽快占领绝对优势。
4. 发菌期感染
① 使用液体菌种接种，接种枪在喷液体菌种时，菌液飞溅导致污染时有发生；接种后没有在净化空气下培养，容易产生污染。
② 接种后置于培养库内，库内净化度过低，导致霉菌随着内外气体的交换而污染。
③ 使用劣质菌袋，或在装袋、搬运过程中引起菌袋破损，培养 5~15d，就会在料面或者菌袋四周表面有星点状散布的菌斑。
二、防治方法
1. 培养料要求新鲜、干燥，配方合理，含水量适中，填料严实，封口严密；玉米芯、大颗粒木屑等不容易吃透水分的原材料需提前进行预湿处理，或延长拌料时间，防止因大颗粒内部吃不透水分而出现灭菌不彻底的情况；灭菌过程进行实时监控，保证灭菌彻底。
2. 严格检查菌种质量，适当加大菌种用量。
3. 接种应全过程无菌操作，接种后的菌袋进出轻拿轻放，防止菌袋破损。
4. 做好培养室及出菇场所内外的环境卫生，废料及时处理。培养室所用的消毒药剂要经常轮换使用，以防病菌产生抗药性。
5. 培养过程中发现杂菌及时处理，培养过程中每隔5~7d检查一次，将杂菌消灭在点片发生阶段；对污染特别严重的菌种通常要立即销毁。
6. 对上一季感染过链孢霉的老菇棚，也可以在栽培种进棚前用专用药剂烟熏，防止链孢霉的再次发生。
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