羊肚菌覆膜发菌技术具有保湿、防涝、避光、保温、抑草的作用，可以减少喷水用工，控制“菌霜”的过度生长，提早出菇，并且实现定向出菇。特别适用于北方地区设施栽培和南方露天栽培或简易设施栽培。覆膜主要以普通农用地膜为主，有白色、黑色或半透明薄膜。不同颜色的地膜所起的作用不同：黑色地膜的防草效果好，在北方日光温室内使用增温效果更为显著；白色地膜防草效果差，但露天栽培增温效果好。覆膜后需要注意温度控制和通风问题，需要定时揭开薄膜进行通风换气。目前改进的方法是：在地膜卷上打孔；除此之外，还要注意揭膜时间，一般南方地区可以在原基形成前或刚形成原基时揭去薄膜；北方地区，尤其是多风的地区，一般在原基形成后，幼菇长至2 cm以后，将膜支起来，搭成拱形，继续起到保温、保湿的作用。