秋冬季是食用菌生产的黄金季节，而每年因制种污染率高造成的经济损失都在２０％左右。建议制种户采用以下５种新方法可大大降低接种污染率：
　　一是瓶装发酵料。在培养基的上方离瓶口４ｃｍ处装入１～２ｃｍ深的发酵料，再灭菌。其优点是杂菌不易侵染培养基，并且菌种的菌龄一致，污染率可降在３０％以上。
　　
　　二是麦粒发芽法。让麦粒发芽后再装瓶灭菌。即一次性让做菌种的麦粒发芽，芽的长度为麦粒长度的１－２倍，再充分晒干贮存。到做菌种的前１天，浸泡麦粒１２小时，直接装瓶灭菌。其优点是省去煮麦粒的过程，发菌快，杂菌少，污染率在２～３％。
　　
　　三是使用液体菌种。传统菌种的固体培养基是ＰＤＡ、小麦粒或木屑等物质，固体培养基的缺点是发菌慢，菌龄不一致，杂菌侵染的几率大。改进的方法是使用液体菌种，液体菌种克服了固体菌种的缺点，可以直接作为栽培种进行栽培，污染率可降至２％。
　　
　　四是从原种瓶的下部接菌。我们知道原种瓶下部的菌种菌龄短，生命力旺盛，并且杂菌少，接菌后菌丝吃料快，污染率低。建议将正常原种瓶口上部１／５的原种弃掉，防止潜在的污染，污染率可降至３％。
　　
　　五、合理安排制种季节，避开不利天气。在高温潮湿环境中，如果温度适宜，杂菌滋生蔓延快，改进方法是在气温较低的时间段接菌，如早晨或晚上。当然，如果在有空调的室内接菌效果更佳。