菌种菌丝“不吃料”是指我们所接的一级菌种或二级菌种菌丝块在培养料中不生长或最初菌丝虽然能生长，但不往培养料内部生长，菌丝逐渐萎缩变黄。最初菌丝“不吃料”现象的原因很多，大家可以参考下列几个因素来调整。
    （1）接种操作不当  如接种时，接种工具经过酒精灯火焰灼烧后还未冷却，我们就用它夹取菌种块，菌丝被烫死；接种时，菌种块靠近酒精灯火焰太近，菌丝被烧死；菌种高温灭菌以后，菌种袋内的培养料尚未冷却我们就接种了，致使菌丝受热死亡；在接种箱或接种室消毒时，过量的使用了烟雾消毒剂，致使菌种菌丝因药害而死亡等等。所以，要求在接种时，接种用的镊子在火焰灼烧后应在管壁或瓶壁上冷却后，再去夹取菌种块，夹取的菌种块不要靠火焰太近，要迅速的通过火焰无菌区送入菌袋或菌种瓶内，以免菌丝烧伤。培养料高温灭菌后，要充分冷却。另外，接种箱或接种室内使用的烟雾消毒剂要严格按照规定量使用，千万不要私自加大用药量。以“菇老爷牌”强力气雾消毒王为例，每立方米空间的最佳使用量为6-8克即可。2010年，我在湖北省随县的一家菌种厂调研时发现，他们在接种时，自作主张将每立方米空间的烟雾消毒剂用药量达到了12克，结果造成20余万斤的菌种，全部产生药害导致菌丝不长。
    （2）培养料不合适   培养料的配方不合理，配制不科学，如碳氮比不合理、PH值不适、料内含有松木、杉木等木屑等等，都能使菌种块不萌发导致“不吃料”。还有，如果培养料过干，菌丝也不能长入培养料内部而造成“不吃料”。因此，。要选择科学配方，注意料内不能含有松木、杉木等木屑。还要保证培养料的合理含水量，以免发生“不吃料”现象。
    （3）菌种老化   在二级菌种和三级菌种的制作过程中，所用的菌种必须是活力强的菌种。如果接入的菌种在不良环境下长期储藏或培养时间过长，造成菌种衰老，引起生活力降低，也会导致菌丝失去生长能力，引起“不吃料”现象。
    （4）害虫危害  如果菌种在养菌过程中出现了螨虫、鼠害等咬噬菌块后，也会致使菌丝消失。所以。菌种在养菌过程中要注意做好防治害虫的工作。