1.蜡质层与菌丝长势的关系：蜡质层是菌丝经充分交织后，在交织物周围出现的白色或浅白色的液体逐渐变硬而成。其液体是由菌丝细胞所分泌，因此在滑菇的发菌阶段，菌丝生长旺盛，细胞代谢所分泌的液体也越多，生成的蜡质层也就越厚；反之，菌丝生长较弱，其蜡质层就越薄，在有杂菌污染的部位，很难形成蜡质层。因此蜡质层的厚薄，可作为发菌好坏的标志。
    2.蜡质层与原基分化的关系：由于蜡质层是角质化的物质，又厚又硬，不但影响原基的分化，而且还影响培养料的透性，在喷水时水分很难穿透到培养料内，因此，蜡质层达10mm左右时在出菇前要将蜡质层刮掉，才能分化出原基。
    3.蜡质层与产量的关系：大量试验证明，蜡质层为5mm～10mm时，子实体分化率和成菇率都高于无蜡质层的菌块。但蜡质层厚度超过10mm时，同蜡质层薄的相比，第一潮的产量差异不明显，而第二潮菇的产量则出现了明显的差异。蜡质层厚度为15mm和5mm时，前者的产量低于后者，这与前者消耗了大量营养有关。由此可知，蜡质层不能没有，但也不能过厚。