毛木耳原种和栽培种的生产原料要根据毛木耳菌株的特性而定，有些菌株适宜在棉籽壳培养料上生长；有些菌株适宜在木屑培养基上生长，选用的母种要求高产优质、发菌快、抗逆性强的菌株，在制种中要求菌种纯度高、生长健壮、不污染、不老化。原种可采用瓶装高温高压灭菌处理；栽培种可采用聚丙烯塑料 袋装高温高压灭菌（或常压灭菌）处理。室内发菌温度最好在25～28℃之间，经30～35天发菌结束，即可使用。常用培养料多为木屑、棉籽壳、玉米芯等，添加一定量的麸皮或玉米粉、蔗糖等。木屑培养基含水量应略少些（最适55％～60％）。
    主要培养基配方：
    （1）木屑58％、棉籽壳30％、麸皮10％、糖0.5％、复合肥0.5％、石膏1％，料：水=1：1.25
    （2）木屑20％、棉籽壳60％、麸皮18％、石膏1％、糖1％，料：水=1：1.3