金针菇子实体生长发育阶段，菌柄基部变黑褐色至黑色糜烂，基部糜烂后，子实体倒伏。幼菇丛发病虽不倒伏，但不能延续向上生长发育，严重发生时，针状的幼菇成丛变黑糜烂。
    病原：瓶梗青霉，属半知菌亚门、丝孢纲、丛梗抱目、丛梗抱科，该病原如在马铃薯蔗糖培养基上，菌丝白色、粉状。培养基呈深红褐色，菌落呈粉红色。抱子梗从气生菌丝上长出，呈对称分叉。与青霉素的分枝类似，但小枝梗顶端着生的分生孢子可形成长链，链长达400—600微米，分生孢子椭圆形、单细胞、无色。
    发生：各地均有发生，以室内床栽较多。多发生于棉籽壳生料栽培的菇床上，生长阶段培养料含水量过高，床面长时间有积水，加之长时间覆盖薄膜，通风不良，湿渡过大，有利发生。
    防治：子实体生长阶段节制适宜的含水量，经常消除床面积水，特别是在子实休生长阶段消除积水特别重要。发现病菇后应及时消除，可收到一定的防治效果。