优良纯化的菌种，是食用菌栽培成功的根本保证。现将几种食用菌母种外观识别方法介绍如下：
香菇菌丝 在马铃薯葡萄糖琼脂培养基上，菌丝纯白色、粗壮，呈絮状或绒状，长满试管后有一定爬壁能力，边缘呈不规则波曲状。在24℃左右温度条件下，菌丝一般12～15天即可长满试管斜面。具香菇特殊香味。
     平菇菌丝 在PDA培养基上，菌丝洁白、浓密、粗壮，菌丝爬壁能力强，可布满试管空间。在25℃温度条件下，菌丝一般6天可长满试管斜面。具平菇特殊香味。
     金针菇菌丝 在PDA培养基上，菌丝灰白色，呈绒状或平贴状，稍有爬壁现象。菌丝老化后，表面常出现污褐色斑，斜面上常产生粉状孢子和小子实体。在23℃温度条件下，菌丝一般10～12天可长满试管斜面。菇香不明显。
     黑、毛木耳菌丝在PDA培养基上，菌丝初始纤细透明，后渐变为白色粗壮的次级菌丝，呈棉絮状，丛生密集，菌丝前端较齐短；后期易产生分生孢子，使表层覆盖有一层粉状物。菌丝不爬壁，久置见强光后斜面上会出现斑块胶质体，近似耳片。在28～30℃温度下，菌丝会分泌深浅不同的色素，毛木耳多为深褐色，黑木耳多为琥珀色。香味不明显。
     气生型双孢蘑菇菌丝 在PDA培养基上，孢子萌发7～9天出现灵芝状菌斑，菌丝健壮细密，尖端粗直清晰，整齐一致，呈扇形伸展，气生菌丝似绒毛状，易在试管中形成菌皮。
     银耳羽状菌混合菌丝 银耳菌与羽状菌按一定比例混合培养后，形成的菌丝短而密，前端整齐。初始期菌丝呈茸毛团状，生长速度较慢；随着培养时间的延长，在茸毛团周围形成一圈紧贴培养基的晕环。