诱变育种的步骤可以概括为三步：第一步制作食用菌孢子悬浮液。制作方法：将食用菌无菌孢子放入磷酸缓冲溶液或者生理盐水中，摇匀即可，浓度一般控制在每毫升溶液含有106～109个孢子为宜；第二步诱变处理，根据食用菌品种及条件选择适宜的诱变方法即可；第三步挑选优良菌株，该步骤是最关键的一步，也是工作量比较大的一个步骤，需要高度重视。因为诱变处理后，只是扩大了变异的范围和变异量，而并不能说明所有的变异都是需要的，因此，要从大量的变异菌株挑选。将变异后的孢子进行培养，长成菌落后及时挑菌，并接入斜面试管内，每个试管只能接一个菌落，长好后再分别接入2～4瓶原种中，进一步进行栽培试验，最后进行反复仔细的筛选比对，挑选出优良的菌株。