大部分香菇品种经过60～70天的发菌培养后，当菌丝达到生理成熟时即可脱袋转色。
　　生理成熟必须同时达到以下几点：1.菌丝长满菌袋;2.长满培养料的浓白菌丝继续发育，菌袋四周的菌丝体出现膨胀;3.袋壁四周膨胀的菌丝上隆起瘤状物，用手握菌袋，有弹性的松软感;4.瘤状物占袋面的三分之二左右;5.接种穴四周，开始出现棕褐色。这时候就可以把香菇菌棒脱袋转色了。
　　脱袋必须掌握好时机，脱袋过早，菌丝没有达到生理成熟，转色困难，不利于子实体发生;脱袋过迟，过于成熟，造成菌膜增厚，影响正常出菇。
　　脱袋后的菌棒，摆放在提前经过消毒处理的菇棚内。要抓紧速度，一畦一畦地摆，菌棒间隔3～5厘米，鱼鳞状摆放。每一畦摆满后，覆上薄膜，一畦成一个小拱棚。
　　脱袋后的3～5天，尽量不要翻动薄膜，使菌袋表面的菌丝在新环境中恢复生长。菌棒适宜的具体的条件是温度尽量维持在18～23度左右，湿度90%左右，使菌丝在一个温暖潮湿的稳定环境中继续生长。如果小拱棚内气温超过25度，我们要及时进行揭膜通风，降低温度;温度太低时，要采取提温和保温措施。同时，要在白天向地面或菇棚空间喷水，但一定不能向菌棒喷水，保持空间相对湿度85%～90%。
　　脱袋后5～6天，当菌棒表面长满浓白色绒毛状气生菌丝时，要增加掀动膜的次数，每天通风2～3次，每次20～30分钟，以增加氧气和散射光照，拉大菌棒表面的湿度差，限制菌丝的生长，促使开始转色。
　　当7～8天开始转色时，可加大通风，每次通风1小时。结合通风，每天向菌棒表面轻喷水1～2次，喷水后要晾1小时左右再盖膜，迫使表面菌丝倒伏并转色。连续喷水2天。
这样经过十天半个月左右的管理，整个菌棒表面变为一层棕褐色的菌膜时就转色完毕。(甘肃省“12316三农”食用菌栽培专家李锦龙)