（1）长相和活力  优质菌种外观水灵、鲜活、饱满，菌丝旺盛、整齐、均匀（蜜环菌除外）这是菌丝细胞生命力强、有较强生长势的表现，是品种种性优良、菌种优质的重要标志。相反，则表明该品种已老化，不宜投入生产使用。 

    （2）老化  老化菌种的特征是外观发干，菌丝干瘪，甚至表面出现菌皮，或有粉状物，菌体干缩，与瓶（袋）分离，还可能有黄水。 

    （3）污染  污染有两种情况，一是霉菌污染，而是细菌污染。霉菌污染比较易于鉴别，污染菌种的霉菌孢子几乎都是有色的，常见颜色有绿、灰绿、黑、黑褐、灰、灰褐、橘红等。有时霉菌污染后又被食用菌菌丝盖住，这种情况下仔细观察可以见到浅黄色的拮抗线。细菌则较难鉴别。细菌污染不像霉菌那样菌落长在表面，一看便知，而是分散在料内。有细菌污染的菌种外观不够白、甚至灰暗，菌丝纤细、较稀疏，不鲜活，常上下色泽不均一，上暗下白，打开瓶塞菇香味很淡。 

    （4）螨害  在我国南方，菌种的螨害时常发生。螨害主要来自培养场所的不洁，菌种培养期从瓶（袋）口向里钻，咬食菌丝。有螨危害的菌种在瓶（袋）内壁可见到微小的颗粒，小得像粉尘，菌种表面没有明显的菌膜，培养料常呈裸露状态。肉眼观察不清时可以用放大镜仔细观察。 

     劣质菌种首先表现为外观形态不正常，如表面皱缩，不平展，不舒展，长速变慢；气生菌丝雪花状、粉状、凌乱、倒伏，生长势变弱；有的是气生菌丝变多、变少或没有；菌丝不是正常的白色，而是呈现微黄色、浅褐色或其他色泽，或由鲜亮变暗淡；有的分泌色素吐黄水；菌体干缩、色泽暗淡、上下色泽不一致、表面有原基或小菇也是劣种的表现。 【来源】：中国食用菌产业科技网