生在菇木上的杂菌，常见的有木霉、裂褶菌、青霉、毛霉、根霉、曲霉等。害虫有蛞蝓、蜗、白蚁等，有害菇木的天牛幼虫、小蠹虫和白蚁等。
    在防治上，菇农应贯彻“预防为主，综合防治”的方针，加强菇场在菇木上的科学管理，创造一个有利香菇生长而不利杂菌、害虫发生的环境。
    菇农应做到防患于未然，一旦发生病虫害要及时采取措施。菇木上的杂菌，可用小刀刮除，或涂2%石灰水。对蜗牛、蛞蝓等害虫，可于清晨或傍晚进行人工捕杀。对白蚁可用亚砒酸60%、 滑石粉40%，或亚砒酸46%、水扬酸15%、氧化铁5%的混合药粉撒施在蚁道、蚁巢上防治。