短段木熟料栽培是传统栽培灵芝的方法，此方法的优点为灵芝品质好、生物转化率较高、经济效益好、成品及合格率高等。

灵芝产量的高低及品质的优劣主要取决于段木的营养成分，栽培灵芝主要用木质较坚硬的壳斗科、金缕梅科、大戟科、桦木科、胡林科、桑科、铃木科、榆树科、锻树科、蔷薇科等树种。树木应在休眠期砍伐，这个时期树木中贮藏的养分多，含水量少，韧皮部和木质部结合紧密，伐后树皮不易剥落。且这一时期树木杂菌与害虫也少。树木胸径大小5~15厘米为宜，砍伐运输过程中要保持树皮完整。砍伐期要求在灵芝栽培前15天左右采伐，接种前1周左右截段，长度一般为12厘米，然后用草绳、塑料绳、铁丝等将小段木捆成捆，捆的切面要平，周围棱角要削平，以免刺破塑料袋，造成杂菌污染。如果段木过干，可以浸入到清水中1~3小时，调整段木含水量。根据段木的长度选择塑料袋的规格，将段木装入后，两头绑紧。

常压灭菌要求100℃保持14~16小时。高压灭菌121℃保持2小时。

选择菌丝洁白、健壮浓密、无杂菌污染、无褐色菌膜、生长旺盛的菌种，菌龄最好不要超过40天。严格按照无菌操作规程进行接种。接种主要在段木两断接入，中间可不接。菌种要紧贴段木切面，这样发菌快，减少污染，成活率高。接完菌种后即可搬入培养室培养。

（1）发菌

接好菌种的菌袋要在通风、干燥、黑暗的环境条件下培养，温度要保持在25~28℃之间。一般培养20天左右菌丝可长满段木表面。在菌丝生长过程中菌袋内会产生大量水珠，这时可结合刺孔放气减少菌袋内积水。开门窗通风换气增加袋内氧气，促进菌丝向木质部深层生长。培养70天左右，菌丝可长满菌袋。

（2）脱袋覆土

脱袋覆土应在菌丝长满菌袋、表面用手挤压有弹性时进行。根据灵芝生理特性，菌木埋土应选择气温在15~20℃的晴天或阴天上午进行，切忌雨天操作。一般畦宽1.5m，畦高10~15厘米，将脱袋后的段木竖直排立在畦内，段木间隔5厘米，行距10厘米，将段木排好后表面覆土2厘米左右。

灵芝是恒温结实性菌类，生长最适温度为26~28℃。灵芝段木覆土后，通常20天左右即可现蕾。灵芝生长需要较高的湿度，子实体分化和生长过程要保持空气相对湿度80~90%左右，土壤湿度前期应保持在16~18%。在水分管理上，要本着晴天多喷、阴天少喷、雨天不喷的原则。灵芝生长对光照相当敏感，如过阴，灵芝子实体柄长盖小，通气不良，则形成“鹿角芝”。光线控制的原则，是前期光线弱，有利于菌丝的恢复和子实体的形成，后期提高光强，有利于灵芝菌盖的增厚和干物质的积累。灵芝为好气性真菌，在良好的通气条件下可形成正常肾形菌盖，如果空气中二氧化碳浓度增至0.1%以上，则只长菌柄，不分化菌盖。为减少杂菌危害，在高温高湿时更要加强通气管理。当发现畦内子实体有相连可能性时，要及时旋转段木，不让子实体互相联结。并且要控制段木上灵芝的朵数，一般直径15厘米以上的段木结芝3朵为宜，15厘米以下的段木结芝1朵为宜，朵数过多会使品质降低。