一、可能造成菌棒污染的原因
1. 培养料本身含有链孢霉孢子。要注意避免培养料被污染，因为大多数链孢霉是从菌棒里面长出来的。
2. 大棚菌棒码垛太高太密集，造成菌棒温度过高。菌棒码垛过高，加上天气热，养菌棚温度高，菌棒在养菌期间本身菌丝生长会发热，故菌棒温度比菌棚温度高5度左右，链孢霉最适宜生长温度25~36℃，含水量53%~67%，加上时而下雨，如地势又偏低，高温高湿场所最容易滋生链孢霉。
3. 随意乱扔已被感染的菌棒。切记不要把已被链孢霉污染的菌袋放在菌场上暴晒或扔到河里。因为在高温高湿的条件下，链孢霉孢子会大量萌发并随风传播，致使空气中存在大量链孢霉孢子。
4. 错误观念。一些菇农认为不用理会链孢霉，菌丝最后会吃掉链孢霉。这个观念是错误的，如果是早期感染，影响了菌种的萌发和定植，链孢霉会消耗掉培养料的养分，菌包里变成了链孢霉的天下，菌丝肯定是没机会生长的，那么是一定不会出菇的。如果是在菌种定植后的感染，菌丝和红色链孢霉一同生长，红色链孢霉会消耗掉一部分培养基的营养，那么一定会导致产量下降。
二、治疗方案
1. 经常检查，发现感染菌棒及时挑选出来，用塑料袋轻轻套住感染菌棒，防止孢子粉乱飞，将好坏菌棒统一隔离开。
2. 将养菌棚的菌垛摆低，降低菌棒温度。
3. 温度升高时和下雨天适当通风，降低温度和湿度。
三、预防措施
此次感染过链孢霉的区域，来年感染几率很大。想要避免，须早做预防措施，食用菌种植一直提倡防大于治，“预防为主，治疗为辅”的方针。
1. 清理大棚及场地，需将大棚及场地喷洒杀灭抑制链孢霉孢子的药物。
2. 拌料预防，在培养料里拌入可以预防杀灭链孢霉的药物，可有效预防菌棒里面长链孢霉。
3. 管理是关键，食用菌生产环节繁琐，每个环节都需要严格把关，这才是增产丰收的好方法。
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