高温期制棒易污染杂菌、影响成品率，因此，要适当推迟制棒接种时间。温度偏高时制棒，要选择优质、新鲜的原辅料；合理配方，严格控制菌棒含水量；发菌室要阴凉通风，且要严格消毒和灭虫；选择优质适龄菌种接种，使菌种尽快萌发定植生长；降低菌棒堆放密度，改善通风散热条件。

最大限度降低发菌室内的温度，定时进行通风换气，有条件的可采取增加发菌室顶部及四周遮荫层厚度或在发菌室顶部进行喷水等措施降温。严禁刺孔、搬动菌棒，以免引起菌丝呼吸代谢加快产热增强，加剧菌棒高温烧菌。需要增氧放气的菌棒应在高温过后进行刺孔，刺孔时要注意通风散热，同时要注意环境卫生，密切观察菇蚊、菇蝇等害虫动态，对发菌室及周围环境须预先进行消毒杀虫。

出菇棚顶及四周可覆盖草苫、遮阳网等，在菇棚地面及四周进行洒水降温，也可在棚顶连续喷水降温。温度超过出菇范围时，可采取降低湿度，暂时进行休眠管理。

菌棒在高温条件下，对病虫害抵抗力下降，需加强病虫害防控。发菌室要定期用石灰粉或杀虫剂进行杀菌灭虫。菌棒进出菇棚之前，应对设施内外环境进行清理消毒、灭菌杀虫。对已出现感染的菌棒，及时清理，若局部出现污染，应及时刮去污染部位的培养料，再用石灰粉（浆）涂抹，另喷霉斑净等药剂进行消毒，以控制受害部位扩展，并进行隔离分类管理。发生重度污染时，须进行高温灭菌后进行开袋晒干处理，或直接进行堆制沤肥。