种苓的品系很多，如云苓（云南产），皖苓（安微产）鄂苓（湖北产）建苓（福建产）。不管哪一个品系优良性状，都是长期自然选择和人工选择的结果。所以只有选择好的品系，才能培养出好的菌种。好的品系确定后。在茯苓采挖季节，选择菌核个大，质坚、皮红（薄），作为种苓进行分离。分离要及时，出土后一般不超过15天，防止久置干燥或长霉影响菌种的生活力。

    二、菌种分离和培养

    1、组织分离：此法是利用茯苓菌核中的菌丝体在培养基上生长发育成纯菌丝体。

    （1）分离培养基：用来分离和培养茯苓菌种的培养基，常用的是：马铃薯200宽（取其煮汁），葡萄糖20克，琼脂20克、加水至1000毫升，高压灭菌80分钟。

    （2）菌接分离：分离前将选好的种苓用无菌水冲洗数次（外表皮），再用纱布揩干。也可用75%的酒精擦洗种苓表皮。分离时在无菌箱或无菌室内，用无菌刀将种苓剖开，用灭菌的接种针从种中央刮取黄豆粒大小菌核组织（苓块）。接种到试管培养基或平板培养基上。接种时要准确迅速采用此法分离到的菌种，其后代均是无性繁殖后代。在不良条件下，往“易发生衰老和退化”，为此必须采用孢子获得茯苓有性繁殖的后代。

    （3）孢子分离

    ①茯苓子实体的生成：茯苓露土或采挖后不久，有些菌核表皮就会长出一种大小不一的蜂窝状子实体。一个手掌大的子实体，大约可产生200亿个担孢子。在气温26℃，空气湿度85%，孢子就大量扩散出来。

    ②孢子的采集：茯苓孢子微小，只有芝麻体积的八百分之一大，掉落后极易被风吹走，为此接种时采用以下几种方法：

    a、空中捕捉法：把试管口的棉塞拔开，使管口对准孢子云，迅速捕捉（试管移动的方向和孢子飘去的方向相反），使孢子落在试管中的培养基表面上。

    b、附着法：把培养皿倒翻过来，使上升的孢子附着在培养皿内的培养基表面上，再把培养皿盖好，进行培养，待长出菌丝后，连琼脂移入试管中培养。
    c、玻璃片采集法：将灭菌的玻璃片置于茯苓菌核上，使上升的孢子藩满玻璃后呈白粉状，然后从玻璃片上挑取少量孢子，接种在培养基上。

    d、贴附法：用无菌解刮刀把茯苓子实体表面切去，再切取一小块子实体，贴附在试管内的培养基上方，待孢子掉落后，挑取落于琼脂培养基表面的茯苓孢子，移入另一管中培养。无论采用哪种分离方法，接种后的试管在82℃以下，培养8天就可以看到孢子或茯苓块长出菌丝体来，这就是茯苓纯菌种，（通指为茯苓母种）。

    三、原种的培养

    为了适应生产需要，必须把母种进行扩大培养，扩大培养的母种通常称为原种。

    1、培养基：成份（%）：松木屑77%，麸皮10%，蔗糖4%，石膏粉1%，水适量。制作方法：将松木屑、麸皮、石膏粉混合拌匀，蔗糖溶于水中。料水比1：1，充分搅拌，使培养料含水量在65%（即手握培养料指间有水痕为度）。这时将其分装于菌种瓶中，压实，中央插一个达瓶底的洞，然后塞上棉塞，高压灭菌，冷却后备用。

    2、接种：在无菌箱或无菌室内，用接种针挑取一块母种，接种在原种培养基上。为了使菌种迅速生长，接种量可以大一些，一般一支母种试管接5瓶为宜。

    3、培养：接种后将瓶子置于82℃下培养，80天菌丝就可以长满全瓶，在培养过程中应注意观察，发现长有杂菌的瓶子应淘汰。

    4、原种的保存：原种长满瓶后，应立刻扩大为栽培种，否则一旦营养耗光，菌丝就会死亡，在个别情况下，原种长满后可以保存一段时间，以备将来使用。但原种必须保存在干燥、冷凉和清洁的地方，防止老原种长霉和发生病虫害，栽培种的培养，原种通过扩大之后，通称为栽培种。

    （1）木屑菌种

    ①培养基成份（%）：松木屑69，麸皮25，过磷酸钙1，蔗糖5，石膏粉5，尿素pH6。

    ②制作方法：先将蔗糖、尿素溶在水里，松木屑，石膏粉、米糠（麸皮），过磷酸钙拌匀后，再将糖水和在里面，使含水量达60%左右，即手握两指间有水痕即可。

    （2）种木菌种

    ①培养基成份66%的种木（长12Cm，宽24Cm，厚1Cm，松木屑10%，麸皮21%，石膏粉1%，蔗糖2%，pH6），高压灭菌冷却后，备用。

    ②制种方法：先把蔗糖溶解在全部用水量的三分之二的水量，倒入锅中；再把干木片放在锅里煮80分钟，煮时任意搅动，使木片吸足糖水，装入菌种瓶中，每瓶约20片，其次是将皮、松木屑、石膏粉一起和匀，然后把煮过木片的糖水拌在一起，装入上述木片周围及表面（约2Cm厚），塞上棉塞，包上牛皮纸，高压灭菌冷却后备用。

    ③接种

    无菌操作挑取原种一块（约花生米大小），接种到培养基上，在28~82C下培养80天，菌丝长满后即可接种到前述的段木或树木桩上。接种后的管理和采收，和木引、肉引等接种方法一样。