选择无杂菌感染的金针菇菌渣，将菌渣用机械粉碎成细颗粒，再与其它原材料混合拌匀，然后加水，再拌匀，调节培养基含水量为65%左右，拌匀的培养基须及时装袋。

装袋用塑料袋规格为17cm×33cm、或20~21cm×30~33cm、或22~23cm×42~45cm等。利用机械将培养基装入塑料袋内，并压实；装入培养料后，袋口上用绳扎着封口；或者上直径为5cm的颈圈，用塑料薄膜封口。

接种  冷却后在接种箱、接种室或接种罩内无菌条件下接种。栽培种的外壁用杀菌剂如0.25%新洁尔灭液，或0.2%高锰酸钾液，或0.1%克霉灵等进行擦洗除菌，瓶口须在酒精灯火焰上灼烧杀菌。挖出瓶口表层老菌种，取下层菌种使用，接种量要完全覆盖培养料上表面。

    发菌  菌袋培养发菌期间，因气温不同采取不同的堆码方式，使其有利于温度控制管理。当气温高于25℃时，应将菌袋单层排放在床架；或“#”字形地堆码在培养室内地面上，共堆码5~6层；或者先在地面上排放一层菌袋，然后排放二根竹竿后，再排放菌袋，如此一层菌袋一层竹竿地排放，使上下层菌袋之间间隔开来，有利于散热降温；在冬季温度较低时，将菌袋多层重迭排放在床架上，并关闭门窗进行保温；或者横积排放在地面上，每排重叠6~7层菌袋，每排之间相距10厘米左右，须在菌袋堆上覆盖塑料薄膜或编织袋进行保温。菌种瓶排放在床架上保温培养。培养发菌期间，黄色金针菇培养发菌期间，要将温度控制在18℃~22℃之间，并且做保温管理是关键。培养至菌丝体长满瓶或袋后，即可进行出菇管理。此外，黄色金针菇菌丝体没有长满袋就有出菇能力，因此可以在菌丝生长到三分之二袋时，可进行出菇管理，这样可提早出菇。

出菇管理  金针菇菌丝体长满袋后，要及时移到菇房内进行出菇管理，但也可在菌丝体尚未长满袋，即菌丝生长量达到三分之二袋时进行排袋出菇，这样可提早出菇，缩短生长周期。将菌袋横积堆码在床架上，去掉封口纸，诱导原基形成；或者挖去袋口表层菌种，即搔菌处理。此外，还可将菌袋直立排放在地面上或床架上进行出菇，直立排袋长出的菇，无效菇少，生长整齐，挺直，但子实体含水量要稍高些。诱导出菇时，将温度控制在5℃~20℃之间，最适温度为12℃~15℃，温度低于10℃时，菌袋中部易形成子实体，从而降低产量。并给予散射光照，使光照强度达5勒~50勒。在完全黑暗条件下，子实体生长不整齐。空气相对湿度保持在80%~90%之间，湿度偏低时，应在袋口上覆盖塑料薄膜保湿，防止袋口表层培养基失水、干燥，影响子实体形成，或者在地面和菌袋上洒水，增加环境中湿度，使环境中空气相对湿度达到80%~90%。当袋口上出现子实体时，开始进入出菇管理。

子实体生长发育期管理  当子实体生长整齐，并且长出袋口的高度达到3cm~4cm时，子实体上套上塑料袋，以提高局部CO2浓度和湿度，促使菌柄生长，抑制菌盖生长，同时维持子实体生长所需湿度。套袋的方法是：用20cm×30cm，或22cm×42cm规格的塑料袋作套袋，作套袋用塑料袋要求清洁、干燥。套袋应在开口诱导出菇时进行，先将塑料袋的一端用橡筋固定在袋口上，并卷曲放在袋口上，这样可避免在子实体长出后再套袋时，损伤幼菇。待子实体长出袋口，适宜套袋时，再拉直塑料袋，使之成筒状，上端用橡筋扎着，并留一个直径为1~2cm大的孔，以利于通风换气，防止子实体大量分枝，长出许多发育不良的子实体。

    环境条件控制  子实体生长发育期间，将温度调节在10℃~20℃，最佳温度为13℃~15℃；子实体生长期间，环境中空气相对湿度控制在70%~85%为宜，子实体生长的湿度是通过套袋来满足，使袋内湿度达到90%~95%。子实体生长期间，环境中光照强度以5勒~50勒为宜，光照强度大于100勒时，子实体菌盖颜色加深，呈褐黄色，但菌柄也不易变色。处于完全黑暗环境下，子实体则生长不整齐。环境中光照以弱光照为好，即能看清操作管理为宜，在弱光照环境下，子实体颜色浅。子实体生长期间，需要较高的CO2浓度，来抑制菌盖展开，促进菌柄生长加长，因此须在金针菇子实体上套上塑料袋，其目的在于提高局部CO2浓度，但也要适当通风换气。同时要将菇房门窗打开，加强通风换气，保持菇房内空气新鲜，若通风不良，菇房内CO2浓度过高时，子实体会变软，含水量增加，质量下降。

    采收及采后管理  当子实体长度达到15cm~18cm，菌盖尚未展开，呈半球形时，即可采收。采收方法是将整丛菇摘下，采收方式有两种，一种是连套袋和菇体一并摘下，另一种是只采收子实体，保留套袋，并反卷后放在袋口上，待下一潮长出后，直接拉直塑料袋作套袋用。    采后管理  采收一潮菇后，待下一潮菇长出袋口并达到3cm~4cm长时，再套袋进行管理，可采收3~4潮菇，其中第一、二潮菇的质量最好，多为优质产品，并且产量也主要集中在第一、二潮，第三、四潮菇的产量较低，并且质量稍次。