可以说，80%以上食用菌生产的灭菌时间是过长的，包括食用菌工厂化和菇农普通食用菌栽培模式。
大多数情况下加大灭菌时间，是因为出现了污染，没有找到具体的污染原因，怀疑是灭菌导致的污染，想法是先别管是不是灭菌不彻底，只要看污染的状态像是灭菌不彻底导致的，就先把灭菌时间延长看看再说，或者提高灭菌温度。
延长灭菌时间，或者提高灭菌温度，直接的影响就是灭菌过度，如果比较严重会影响菌种的萌发和菌丝不吃料，以及生长缓慢。对于液体菌种的影响就更为严重。间接的影响是带来生产成本的增加，一个食用菌工厂每天都要灭菌，是以天为单位的重复浪费，一天，一个月，一年下来，浪费的可不是一点半点了。
引起食用菌生产污染的原因很多，从灭菌锅降压到“0”的那一刻开始，时时刻刻都存在污染的可能，在出现污染的时候，我们要从多方面去分析是哪一个环节导致的污染，而不应该盲目判断是灭菌造成的，实际上，因为灭菌不彻底导致的污染案例并不多，是食用菌生产者对于灭菌的重要性太过紧张，担心如果灭菌不彻底会产生严重的后果，灭菌过度的现象就出现了。
增长灭菌时间，提高灭菌温度都很容易，反之，减少灭菌时间，降低灭菌温度就十分困难了。以前生产正常，污染率正常，很少有食用菌工厂主动去减少灭菌时间，即使更换了新的技术员，也轻易不会去那样做，一般都会追求生产的稳定性。（来源：泽海菌业）
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