蛹虫草是寄生在虫蛹上的一种菌体，颜色绚丽，呈橘黄色或橘红色，蛹虫草在出草的时候，从蛹体内部破出，到长成成草，尾部都是一直夹带着虫蛹壳的。蛹虫草出草不易，分原基期、幼草期、成草期，每个阶段的光照、温度、相对湿度及CO2浓度都要根据其生长的状况进行调节，过程中也还会出现一些问题。
在原基期，需控制温度18～20℃，光照强度为250～350lx，LED灯光照24h/天，利用加湿器控制相对湿度为80%～85%，利用新风系统通3～5min/h，使CO2质量浓度不高于0.5%。空气相对湿度较幼草、成草阶段大，目的是为了利于原基更好的萌发。
在幼草期，控制温度16～18℃，控制子实体的生长速度，使子实体粗细合适，温度过高子实体生长速度过快、过细，后期容易出现倒伏。光照强度为100～150lx（LED灯，18h/天），降低光照亮度，使草的颜色为浅黄色，适宜生长，如果光照过强，将使草颜色加深，抑制生长，过早的进入成熟期，降低品质和产量。空气相对湿度70%～75%，CO2浓度不高于0.5%，通风3～5min/h。同时微降相对湿度，保持在75%左右，控制气生菌丝及霉菌的萌发。此时期切忌通风差、温度高、湿度高，以防止虫草子实体发生指孢霉软腐病，造成绝收。
在熟草期，温度控制在16～18℃。光照强度为200～300lx（LED灯，18h/天），提高光照强度促进草的颜色加深，转成橘红色，使草进入成熟期。相对湿度70%～75%，CO2浓度不高于0.5%，通风3～5min/h。在出草管理期阶段，环境条件的控制是至关重要的。在对光、温、湿、气的管理上要参照蛹虫草的生物学特性，针对不同的培养期生理阶段进行调控，掌握好每一时期的关键技术点。
出草过程容易产生出草稀疏，产生分支等问题。出草稀疏，产生分支一般是因为栽培季节选择不当，菌丝转色后，遇连续低温或高温的环境条件；培养室光照太强，通风差；使用劣质菌种，种性较差。因此应避免遇到15℃以下低温和28℃以上的高温；加大通风和保持200～500lx的光照；使用经出草试验高产优质适龄菌种。
当蛹虫草长6～10cm，颜色慢慢由浅黄色变深，草的中上部开始出现成熟的孢子，蛹虫草头部出现龟裂状花纹，表面出现黄色粉末状物（孢子即将弹射），表明已经成熟，就要开始采收了。蛹虫草采收过早，营养积累没有达到最高点，影响量；采收过晚，子囊孢子已开始散发，会消耗营养而降低有效成分。
采收时，需套上用酒精消毒乳胶手套，用无菌镊子或剪刀从子实体基部采下，尽量不要碰伤子实体。同时去掉根部残渣和污物，将丛生的基部互相联结的子实体分开，并清除携带的部分培养基。然后将采收的蛹虫草整齐地放在一起，最好直接放在洁净的烘干筛子上，以便及时烘干或晾干。注意千万不要在太阳光下曝晒，以防子实体褪色。采收要及时，采收过早，营养积累没有达到最高点，影响产量；采收过晚，子囊孢子释放，会倒伏、枯萎、腐烂，消耗营养而降低有效成分。采收完需对栽培室进行彻底清扫消毒处理。
工厂化一般只采收一茬，如小规模种植户，在采收后补充一定的营养液，将培养基稍压平，再扎薄膜放到适温下遮光使菌丝恢复生长。待菌丝恢复后再进行光照等处理，使原基、子实体再次发生，可采收二潮虫草，产量及质量不如头潮菇。采收与分级可同时进行，按照分级标准将各等级的蛹虫草分别放置。目前用小麦、米饭培养的蛹虫草子实体尚无统一标准，辽宁等地根据子实体的色泽、粗细、长度等不同分为四个级别，具体如下。
特级子实体：长8cm以上，淡红棕色，粗细均匀，无根基，无杂质，无烤焦，无霉变，无虫蛀，无异味。一级子实体：长7～8cm，色金黄，无白色，无根基，无杂质，无烤焦，无霉变，无虫蛀，无异味。二级子实体：长6～7cm，色红黄，上粗下细，边皮修剪粗细均匀，无根基，无杂质。等外子实体：为长5cm以下的剪货、渣皮、碎货等。
如果蛹虫草栽培的规模不大，数量不多，可采用自然干燥方式。在晴朗的天气晾干蛹虫草，避开阴雨天气，否则蛹虫草子实体易变褐、变黑甚至霉烂。将采收的蛹虫草子实体摊放在筛帘或竹席上，置阴凉通风处进行晾晒，要经常翻动，以加速干燥。晒到含水在12%以下时即可。经过干制的蛹虫草子实体其重量为鲜重的1/6，体积为鲜草的1/3，颜色要比鲜品深些，呈橘黄色，烘干时间一般需要6h左右。当蛹虫草干品降至室温时，装袋密封，遮光、低温储存。自然干燥使用的工具简陋，成本低，但产品的质量得不到保证。
也可利用电能加热的烘干设备，可以用木板做成烘干箱的箱体，里面设置多层层架，放置烘干筛，通过在箱内设置的电阻丝来加热，使虫草表面受热促进水分扩散，以至烘干。它不受自然条件的限制，易于控制干燥条件，时间短，效率高，质量好，还可以杀死一些虫卵、霉菌的孢子等，能提高产品的商品价值和延长保存时间。具体方法如下：
将子实体按照色泽、粗细、长度等要求分为不同的等级，整齐均匀摆放在烘干盘里，每平方尺大约摆放0.5kg。采收后的蛹虫草及时烘干，烘烤时，缓慢升温（起始温度36℃，每小时升温小于等于7℃，烘烤温度60℃），同步排湿，最后1h70℃烘烤，至蛹虫草含水量下降到12%为止。注意干燥过程最好不要翻动，当烘至触摸虫草有扎手的感觉，用手能掰断子实体时，这时说明含水量已经达到12%，干燥可以结束了。此时的子实体容易折断，因此需要在房间放置4～6h回潮，注意事先在房间地面洒点清水，回潮的蛹虫草干燥且柔软，易于包装。
烘干过程中注意事项：将分级的子实体均匀地摊在烘干筛上，然后进行预晒。在烘烤之前，最好预晒2～3h，使表层大量自由水迅速蒸发，以节省能源。表面水分散发一些后，至草体发软就可以放入干燥设备中进行烘干。无论采用何种干燥设备，在烘制时一定要掌握好温度、排湿、倒盘及烘烤时间。温度控制是保证质量的关键，一般干燥过程中的温度控制在40～60℃。
排湿有利于水分的蒸发，加速干燥。但排湿的同时，伴随有热量的损失。所以，当烘室（箱）中湿度达到60%以上时，应开始排湿。每次排湿10～15min。时间过短起不到排湿的作用，时间过长温度下降幅度较大。在烘干中还要倒换烘盘，一般的烘室，不同的部位之间存在着一定的温差，为使烘干的蛹虫草质均匀一致，必须定时倒盘。
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